Obsadzanie skał i kamieni roślinami jest fascynującym zajęciem, ale wymaga trochę zręczności do prac ręcznych. Koniecznie potrzebna jest umiejętność obchodzenia się z piłą mechaniczną, wiertarką, młotkiem i dłutem. Istnieją różne możliwości pracy ze skalami:

•    sadzenie w skale (roślinę sadzimy korzeniami w jednym lub wielu zagłębieniach skalnych),
•    sadzenie na skale (korzenie bonzai obejmują skalę),
•    drzewko bonsai zostaje zasadzone obok skał i uformowane w postaci krajobrazu (sakai). Ten sposób formowania jest bardzo łubiany. Tutaj zjednoczone są harmonijnie różne elementy (skały różnej wielkości, mech, rośliny, piasek lub okruchy skalne), przy czym powstaje odpowiednio zminiaturyzowany krajobraz.

Narzędzia i materiał
•    wiertła udarowe do wybijania w kamieniu zagłębień dla roślin i do wiercenia otworów dla drutów,
•    wąski, długi przecinak i młotek do przycinania kamienia,
•    jasna kreda do zaznaczania miejsc wiercenia otworów,
•    drut do bonzai o grubości 2 mm, do kotwiczki drucianej,
•    blacha ołowiana, pocięta na kawałki, do klinowania drutu w wywierconym otworze,
•    skala, kawałek kamienia ok. 30 cm wysokości (na krajobraz) lub wiele skałek, dających się harmonijnie poustawiać,

•    3-5 roślin, trochę mchu, gleba do bonsai, trochę żwiru i piasku,
•    plastyczna glina na podłoże do mchu,
•    misa do bonsai bez otworów odpływowych, owalna, prostokątna lub okrągła.

Można na przykład wybrać piękną skałkę, jedną lub wiele sosen, a jako podszycie azalię lub irgę. Do pokrycia podłoża nadaje się drobny zwarty mech.

Trzeba jednak bardzo uważać i nie używać zbyt wielu elementów, ponieważ taki zestaw stanie się przeładowany i pozbawiony smaku. Sztuka krajobrazu bonzai polega na unikaniu nadmiaru składników.

Skały i kamienie można kupić w centrum ogrodniczym lub w punktach handlu drzewkami. Przy zakupie trzeba zwracać uwagę, żeby materiał miał naturalne kształty i nie był cięty lub gładko obrobiony. Proste linie pęknięć nic pasują do naturalnego formowania. Materiał skalny powinien być dość kruchy, żeby się larwo dawał obrabiać. Szczególnie dobrze nadaje się do tego pumeks. Daje się on piłować, wiercić i dobrze obciosywać. Poza tym długo utrzymuje wodę i powoli oddaje ją roślinie.